ͯÑÕÊÓƵ

Om faciliteten

Vi erbjuder stöd i planering och genomförande av masspektrometribaserade proteomikexperiment. Detta inkluderar rådgivning kring experimentell design och provberedning. Vi utför provbearbetning, mätningar och dataanalys. Användaren får tillgång till bearbetade data samt en inledande statistisk analysrapport som underlag för vidare biologiska studier.

Exempel på analyser som kan utföras:

• Identifiering av proteiner i ett prov (t.ex. proteiner framrenade i gel eller lösning samt isolerade proteinkomplex)
• Jämförelse av proteinnivåer i hela proteomet (t.ex. cancer jämfört med frisk vävnad eller vätskebiopsi, vildtyp jämfört med mutant, behandlad jämfört med kontroll)
• Identifiering av proteininteraktioner efter immunoprecipitering
• Identifiering av posttranslationella modifieringar (t.ex. fosforylering, glykosylering, SUMOylering och ubiquitinering)

För andra typer av proteomikrelaterade frågeställningar är ni välkomna att kontakta oss för vidare diskussion.

Instrument på faciliteten

Faciliteten är utrustad med två Orbitrap Exploris 480-system kopplade till Vanquish Neo nanoflödes-LC.

Orbitrap Exploris 480

Orbitrap Exploris 480 (Thermo Scientific) är ett masspektrometrisystem baserat på Orbitrap-teknologi, utformat för högupplösande analys med hög massnoggrannhet inom proteomik och bioterapeutisk forskning

. Instrumentet stödjer flera typer av arbetsflöden, inklusive explorativ och riktad kvantitativ analys, TMT-multiplexering samt proteinkarakterisering.

Vanquish Neo nanoflow LC

Vanquish Neo UHPLC-systemet (Thermo Scientific) är ett lågflödesbaserat vätskekromatografisystem utvecklat för nano- och kapillärflödesbaserade LC-MS-applikationer inom proteomik och peptidanalys. Systemet möjliggör analys av biologiska prover med låg volym och hög komplexitet och kan arbeta över ett brett flödesområde, från nanoflöde till mikroflöde, på samma plattform utan modifiering.

Tillgänglighet

Tillgänglighet inom Umeå universitet

Tjänsterna är tillgängliga för forskare vid Umeå universitet. För information om avgifter och villkor, vänligen kontakta plattformen.

Tillgänglighet för externa användare

Externa användare är välkomna att kontakta oss angående tillgång till infrastrukturen. Externa forskare hänvisas dock i första hand till nationella infrastrukturtjänster. Följ länken till .

Kontakta oss

Föreståndare för faciliteten

Andre Mateus Biträdande universitetslektor, övrig/annan befattning

E-post

Iker Aramburu Forskare

E-post

090-786 98 79

Personal vid faciliteten

Shaochun Zhu Staff scientist

E-post

¹ó¾±²Ô²¹²Ô²õ¾±Ã¤°ù±ð°ù