Staff scientist inom molekylär AI och patogensystembiologi
Institutionen för molekylärbiologi
senast
2025-11-19
Särskild visstidsanställning
100%
Umeå
Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.
Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.
Institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet söker en Staff Scientist inom molekylär AI och patogensystembiologi för en begränsad anställning på 12 månader. Anställningen förväntas påbörjas i februari 2026 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är den 19 november 2026.
Beskrivning
Vår forskning fokuserar på mikrobiell nischanpassning och stressresponser, med hjälp av integrativa multi-omikmetoder (t.ex. bulk- och singelcellstranskriptomik, metagenomik) i kombination med avancerade AI- och LLM-tekniker. Den anställda forskaren kommer att leda utvecklingen av analys- och kunskapsverktyg baserade på stora språkmodeller (LLM), såsom retrieval-augmented generation (RAG) över omikdata och litteratur, automatiserade data-till-insikt-sammanställningar samt agentbaserade arbetsflöden. Rollen är tvärvetenskaplig och innefattar nära samarbete med molekylärbiologer, bioinformatiker och externa samarbetspartners.
Arbetsuppgifter
Designa, bygga och underhålla AI/LLM-baserade analysflöden för multi-omikdata och vetenskaplig litteratur (inkl. RAG, utvärderingsramverk, säkerhetsmekanismer och dokumentation). Leda integrativa analyser av komplexa dataset och leverera tydliga visuella och narrativa beslutsunderlag. Säkerställa reproducerbarhet genom versionshantering, containerisering, arbetsflödesorkestrering och dokumenterade analyser. Bidra till vetenskapliga publikationer, forskningsansökningar och handledning inom AI/ML och dataanalys. Koordinera samarbeten och stödja datastyrning enligt FAIR-principerna.
Kvalifikationer
1. Doktorsexamen i molekylärbiologi, beräkningsbiologi, biomedicinsk datavetenskap eller närliggande område. 2. Cirka fem års postdoktoral forskningserfarenhet med dokumenterad expertis inom patogen- eller mikrobiella system (t.ex. stressresponser, nischanpassning, värd–patogeninteraktioner). 3. Praktisk erfarenhet av stora språkmodeller och modern maskininlärning: prompt engineering, parameter-effektiv finjustering, RAG, vektorbaserade databaser, utvärderingsmetoder och implementering av forskningsanpassade AI-verktyg. 4. Goda programmeringskunskaper i Python (gärna även R); erfarenhet av datahantering för omikdata, containerteknik, CI/testning samt högkvalitativ visualisering och rapportering. 5. Stark vetenskaplig meritlista som visar både metodologisk innovation och biologisk förståelse. 6. Utmärkta kunskaper i engelska, både i tal och skrift, samt dokumenterad förmåga att samarbeta, kommunicera komplexa resultat och bidra till forskningsansökningar och handledning. 7. Erfarenhet av miljö- eller klinisk metagenomik/metatranskriptomik, singelcellsdata samt arbete med ontologier och metadata-standarder. 8. Undervisningserfarenhet inom AI/ML riktad till livsvetenskapliga forskare samt utveckling av interna forskningsverktyg. 9. Dokumenterad erfarenhet av att erhålla eller stödja forskningsfinansiering.
Meriterande
1. Erfarenhet av miljö- eller klinisk metagenomik/metatranskriptomik, singelcellsdata samt arbete med ontologier och metadata-standarder. 2. Undervisningserfarenhet inom AI/ML riktad till livsvetenskapliga forskare samt utveckling av interna forskningsverktyg. 3. Dokumenterad erfarenhet av att erhålla eller stödja forskningsfinansiering.
Som medarbetare hos oss bidrar du till en inkluderande kultur och ett positivt arbetsklimat. Det innebär att du kommunicerar effektivt över olikheter, visar samarbetsvilja och förmåga att arbeta i team. Du är öppen, välkomnande och visar respekt, empati och omtanke. Du stödjer kollegor med olika bakgrunder och perspektiv, och främjar en sund balans mellan arbete och privatliv – både för dig själv och andra.
´¡²Ô²õö°ìan
´¡²Ô²õö°ìan ska innehÃ¥lla: 1. Ett personligt brev (max 2 sidor) där du beskriver din lämplighet, hur du vill vidareutveckla vÃ¥ra LLM-baserade analysverktyg samt din vision för integrativa patogenanalyser. 2. Ett CV med dokumenterad akademisk utbildning och tidigare anställningar. 3. Publikationslista (markera särskilt AI/LLM- och systembiologiska arbeten). 4. Kopia av doktorsexamen och andra relevanta examensbevis. 5. Namn och kontaktuppgifter (inkl. e-post) till tvÃ¥ eller tre akademiska referenser. 6. Övrig relevant dokumentation (t.ex. kodarkiv, programvarudemonstrationer, undervisningsmaterial). ´¡²Ô²õö°ìan ska skickas in via vÃ¥rt e-rekryteringssystem Varbi, senast den 19 november 2026.
Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.
