ͯÑÕÊÓƵ

Forskargruppen Dwibedi vid Institutionen för klinisk mikrobiologi och Laboratoriet för molekylär infektionsmedicin Sverige (MIMS; ), Umeå universitet, söker en postdoktor (2 år) inom bioinformatik. Projektet syftar till att undersöka mikroorganism-mikroorganism och värd-mikroorganism-interaktioner i tidig ålder samt hos individer med typ 2-diabetes.

¹ó´Ç°ù²õ°ì²Ô¾±²Ô²µ²õ´Ç³¾°ùÃ¥»å±ð

Forskargruppen strävar efter att kartlägga mikroorganism-mikroorganism och värd-mikroorganism-interaktioner inom longitudinella dataset från människans tarmmikrobiota.

Din roll

Du kommer att bedriva forskning i Chinmay Dwibedis laboratorium (www.dwibedilab.org) i nära samarbete med lokala och internationella experter. Du kommer särskilt att använda bioinformatiska och statistiska metoder för att analysera data från människans tarmmikrobiom i stora kohorter.

´¡²Ô²õ±¹²¹°ù²õ´Ç³¾°ùÃ¥»å±ð²Ô

- Analys av mikroorganism-mikroorganism och värd-mikroorganism-interaktioner i flera kohorter (n = 2500)
- Utvärdera skillnader i fitness hos specifika stammar i olika populationer
- Studera struktur och funktion hos mikrobiella gener över olika stammar
- Delta i och bidra till vetenskapliga gruppmöten
- Koordinera uppgifter med samarbetspartners
- Bidra till publicering av forskningsresultat
- Delta i utbildning och handledning av forskare och forskarstuderande
- Följa universitetets policyer för lika möjligheter och dataskydd

Urvalskriterier

Obligatoriska krav:

- Doktorsexamen i beräkningsbiologi, bioinformatik eller datavetenskap med fokus på tarmmikrobiomdata
- Utmärkta skriftliga och muntliga kunskaper i engelska
- Betydande erfarenhet av att hantera stora metagenom-dataset (försteförfattarpublicering krävs)
- Relevant erfarenhet av programmering i R och/eller Python (t.ex. utveckling av pipelines för metagenomanalys, skapande av metagenomassemblies)
- Förmåga att arbeta både självständigt och i team
- Förmåga att leverera resultat enligt krav och tidsplan
- Förmåga att organisera och prioritera egna uppgifter med minimal handledning

¹ó´Ç°ù²õ°ì²Ô¾±²Ô²µ²õ³¾¾±±ôÂáö

Dwibedi-labbet är en del av SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (DDLS; ), ett 12-årigt initiativ för att rekrytera och utbilda nästa generation datadrivna livsvetare.

Du kommer att vara knuten till Institutionen för klinisk mikrobiologi vid Umeå universitet (/en/department-of-clinical-microbiology/) samt till det nationella DDLS-programmet, vilket ger tillgång till beräkningsresurser, forskarskola och andra utbildnings- och nätverksmöjligheter i Sverige.

Du kommer även att vara knuten till MIMS (), som är medlem i Nordic EMBL Partnership for Molecular Medicine. Det finns möjligheter till samarbete med experter i Europa och globalt. Lokalt är forskargruppen även knuten till Umeå centrum för mikrobiell forskning (UCMR; /ucmr/om-ucmr/), ett tvärvetenskapligt forskningscentrum med fokus på mikrobiell patogenes.

Sammanfattning av stipendiet

- Heltid, 2-Ã¥rigt stipendium (skattefritt)
- Start: Tidigt 2026

Kontaktperson

Chinmay Dwibedi
Institutionen för klinisk mikrobiologi
E-post: chinmay.dwibedi@ͯÑÕÊÓƵ

´¡²Ô²õö°ìan

´¡²Ô²õö°ìan ska innehÃ¥lla:

1. Personligt brev med motivering och kvalifikationer
2. CV inklusive publikationslista
3. Kopia av doktorsexamensbevis och andra relevanta examensbevis
4. Kontaktuppgifter till två referenser