ͯÑÕÊÓƵ

ÌýPostdoktoralt stipendium (2 Ã¥r) inom växtmolekylärbiologiÌý

Institutionen för fysiologisk botanik erbjuder ett postdoktoralt stipendium inom projektet Con-TEki, som undersöker rollen hos transposabla element (TEs) som drivkrafter för regulatorisk innovation i barrträd (gran och tall). Stipendiet avser heltidsstudier under tvÃ¥ Ã¥r med startdatum 1 augusti 2026 eller enligt överenskommelse.Ìý

Institutionsspecifik informationÌý

Institutionen för fysiologisk botanik vid UmeÃ¥ universitet är en del av UmeÃ¥ Plant Science Centre (UPSC; www.upsc.se), en internationellt ledande forskningsmiljö med cirka 200 forskare inom växtbiologi, inklusive molekylärbiologi, genomik och bioinformatik. UPSC erbjuder avancerad infrastruktur för sekvensering, encellsteknologier och experimentell växtforskning, samt en starkt samarbetsinriktad forskningsmiljö.Ìý

För mer information om Nathaniel Streets forskargrupp, se /en/staff/nathaniel-street/Ìý

±Ê°ù´ÇÂá±ð°ì³Ù²ú±ð²õ°ì°ù¾±±¹²Ô¾±²Ô²µÌý

Att etablera robusta encellsmetoder i tekniskt utmanande växtsystem representerar en central utmaning inom modern växtgenomik. Medan encells- och enkärnsekvensering har revolutionerat forskning i modellorganismer, har motsvarande metoder ännu inte etablerats för barrträd, främst pÃ¥ grund av svÃ¥righeter med vävnadsstruktur, kärnisolering och känslighet för inhibitorer.Ìý

Detta projekt syftar till att utveckla och optimera experimentella arbetsflöden för enkärnebaserad sekvensering i gran och tall, inklusive isolering av högkvalitativa kärnor samt etablering av reproducerbara protokoll för bibliotekspreparering och sekvensering.Ìý

Projektet bygger pÃ¥ en ny mikrofluidisk plattform tillgänglig genom samarbete med Johan Henrikssons forskargrupp (Institutionen för molekylärbiologi, UmeÃ¥ Universitet), vilket ger en unik möjlighet att arbeta med en framväxande teknologi och anpassa den till växtsystem där standardlösningar inte fungerar.Ìý

De data som genereras kommer att komplettera befintliga genomiska dataset och möjliggöra analys av genreglering pÃ¥ celltypsnivÃ¥. Projektet har ett särskilt fokus pÃ¥ att säkerställa hög datakvalitet och att utveckla robusta metoder som kan tillämpas i framtida studier av barrträd.Ìý

Inom ramen för detta postdoktorsstipendium ges goda möjligheter att utveckla avancerad kompetens inom experimentell molekylärbiologi, metodoptimering och kvalitetssäkring av sekvenseringsdata i en tvärvetenskaplig kontext. Projektet är särskilt väl lämpat för kandidater med ett starkt intresse för utveckling och optimering av experimentella metoder.Ìý

Postdoktorsstipendiaten ges möjlighet att:Ìý

• Utveckla och optimera protokoll för isolering av cellkärnor frÃ¥n tekniskt svÃ¥rbearbetade växtvävnader
• Etablera och förbättra bibliotekspreparering för enkärne-RNA-sekvensering och analys av kromatintillgänglighet
• Systematiskt utvärdera och förbättra datakvalitet, signal/brus-förhÃ¥llanden och reproducerbarhet i experimentella arbetsflöden
• Identifera kritiska steg i arbetsflöden och implementera optimeringar för att maximera utbyte och kvalitet
• FÃ¥ erfarenhet av tolkning av sekvenseringsdata och kvalitetskontroll i nära samarbete med bioinformatiker
• Aktivt delta i en tvärvetenskaplig miljö med nära samspel mellan experimentell och beräkningsmässig forskning

°­±¹²¹±ô¾±´Ú¾±°ì²¹³Ù¾±´Ç²Ô±ð°ùÌý

För att vara behörig för ett postdoktoralt stipendium ska personen ha avlagt doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten dÃ¥ beslut om stipendiatmottagare fattas. För att vara aktuell som postdoktorstipendiat bör i första hand den komma i frÃ¥ga som avlagt examen högst tre Ã¥r sedan frÃ¥n sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i frÃ¥ga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet pÃ¥ grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesomrÃ¥det relevant tjänstgöring/uppdrag. ÌýÌý

Doktorsexamen ska vara inom molekylärbiologi, genetik eller ett närliggande ämne.Ìý

Ytterligare krav är Ìý

• Dokumenterad, praktisk erfarenhet av molekylärbiologiska tekniker, särskilt arbete med nukleinsyror och bibliotekspreparering för sekvenseringÌý
• Erfarenhet av att utveckla, anpassa eller optimera experimentella protokollÌý
• Erfarenhet av högkapacitetssekvensering (t.ex. RNA-seq, ATAC-seq eller relaterade metoder)Ìý
• FörmÃ¥ga att kritiskt bedöma datakvalitet och identifiera källor till variation i experimentella dataÌý
• God förmÃ¥ga att dokumentera och reproducera experimentella arbetsflödenÌý
• Goda kunskaper i engelska, bÃ¥de i tal och skrift

Meriterande ärÌýÌý

• Erfarenhet av encells- eller enkärnebaserade metoderÌý
• Erfarenhet av arbete med växtmaterial, särskilt vedartade eller svÃ¥rbearbetade vävnaderÌý
• Erfarenhet av mikrofluidik eller avancerade biblioteksprepareringsmetoderÌý
• Erfarenhet av kvalitetskontroll och preliminär analys av sekvenseringsdataÌý

ÌýÌýVi söker dig som Ìý

• Kan utföra experiment med hög noggrannhet och kvalitet
• Har förmÃ¥ga att självständigt identifiera och lösa tekniska problem i laboratorietÌý
• Kan tillämpa ett systematiskt tillvägagÃ¥ngssätt för metodutveckling och optimeringÌý
• Trivs i en miljö där experimentell utveckling stÃ¥r i centrumÌý

´¡²Ô²õö°ìan Ìý

´¡²Ô²õö°ìan ska vara skriven pÃ¥ engelska eller svenska och bifogade dokument ska vara i Word eller pdf-format. ´¡²Ô²õö°ìan ska registreras via UmeÃ¥ universitets e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast 3 juli, 2026.Ìý

ÌýEn fullständig ansökan ska innehÃ¥lla:Ìý

• Personligt brev (max 2 sidor) där du beskriver dina erfarenheter av experimentell metodutveckling och hur dessa relaterar till projektet
• CV med publikationslista
• Verifierad kopia av doktorsexamensbevis eller dokumentation om förväntat examensdatum
• Kontaktuppgifter till 2–3 vidtalade referenser
• Eventuella övriga handlingar som den sökande vill Ã¥beropaÌý
  Ìý

Övrigt informationÌý

För mer information, kontakta Professor Nathaniel Street, UmeÃ¥ universitet, nathaniel.street@ͯÑÕÊÓƵÌý

Välkommen med din ansökan! ÌýÌý