ͯÑÕÊÓƵ

Om kursen

Den här kursen är tänkt att ge en överblick över ekologiska och evolutionära processer hos naturliga populationer och de molekylära metoder som används för att studera dessa processer.  Kursen introducerar grundläggande koncept inom populationsgenetik, meta-genomik, och landskapsgenetik metoder för förstå mekaniken hos de evolutionära krafter som verkar i naturliga system. Studenter kommer att få en förståelse om hur de vamligaste molekylära metoderna fungerar, samt dessa metoders styrkor och begränsningar i sina kopplingar till ekologi. Särskilda ämnen inkluderar att identifiera genetisk variation mellan och inom populationer, artbildning, urval och lokal anpassning, miljö-DNA (eDNA) protokoll och biologisk bevarande. Kursen förklarar de senaste teknologiska framstegen för att ge studenter en uppdaterad i guide till de allt mer förekommande användandet av molekylära data i ekologiska studier och miljö-övervakning.

Kursen består av föreläsningar, litteraturseminarier, DNA-lab, datorövningar och självständiga arbeten där eleverna kommer att använda empiriska och simulerade dataset till att tolka genetisk diversitet på individ, population och samhällsnivå. Studenter kommer att använda eDNA data till att analysera och lösa evolutionära och ekologiska problem, t.ex. klimatuppvärmning, lokala föroreningar, introduktion av invasiva arter.

Kursen är indelad i två moduler:

Modul 1, Evolutionär genetik och bevarande (5 hp) berör genetikteori, analys och tolkning av molekylärt data kopplat till specifika ekologiska, genetiska och evolutionära tillämpningar. Denna modul är indelad i två sektioner: 1) variation mellan och inom populationer samt artbildning, och 2) fylogeografi och bevarandegenetik. Deltagande i datorövningar, litteraturseminarier och projektuppgifter är obligatoriska.

Modul 2, eDNA för forskning om biologisk mångfald (10 hp) fokuserar på tillämpningen av eDNA-tekniker i miljöövervakning, för att spåra och karakterisera biologisk mångfald i naturliga system. Delkursen består av föreläsningar, datorövningar och projekt. Studenterna får insikt i principerna och arbetsflödet för eDNA-analys, från experimentell design till datatolkning (sektion 1). Studenterna utför praktiskt arbete (provtagning, DNA-extraktion och PCR) och datorövningar (bioinformatik och dataanalys (sektion 2). Studenter arbetar i grupper om ämnen relaterade till tillämpningen av eDNA-metoder för att studera den biologiska mångfalden i terrestra eller akvatiska ekosystem och presentation av sina resultat (sektion 3). Deltagande i provtagning, laborationer, datorövningar och projektuppgifter är obligatoriskt.